MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81116

Total Repeats: 2650

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009839	AAAT	2	8	1339	1346	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009839	A	7	7	1358	1364	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009839	ATT	2	6	1399	1404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009839	GAA	2	6	1412	1417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009839	CAA	2	6	1429	1434	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_009839	TAAAAT	2	12	1455	1466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009839	GAA	2	6	4899	4904	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009839	T	7	7	6521	6527	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009839	TAT	2	6	6532	6537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009839	AAT	2	6	6554	6559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009839	A	7	7	6583	6589	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009839	ATT	2	6	6593	6598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009839	TAAAA	2	10	6616	6625	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009839	TTA	2	6	6644	6649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009839	T	6	6	6663	6668	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009839	ATT	2	6	6688	6693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009839	T	6	6	8030	8035	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009839	ATTT	3	12	8037	8048	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009839	A	7	7	8074	8080	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009839	TTA	2	6	8125	8130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009839	AAG	2	6	14676	14681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009839	A	6	6	14954	14959	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009839	T	6	6	15658	15663	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009839	TAT	2	6	15682	15687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009839	A	7	7	15688	15694	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009839	TAA	2	6	15708	15713	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009839	TAT	2	6	15718	15723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009839	AAAT	2	8	15742	15749	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009839	A	6	6	15784	15789	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009839	TTA	2	6	15790	15795	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009839	AAAAT	2	10	18044	18053	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009839	TTTA	2	8	18070	18077	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009839	T	6	6	19348	19353	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009839	AATTTA	2	12	19356	19367	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009839	T	6	6	21876	21881	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009839	A	6	6	21914	21919	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009839	ATT	2	6	24662	24667	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009839	TAA	2	6	24668	24673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009839	T	6	6	24680	24685	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009839	T	6	6	25579	25584	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009839	ATT	2	6	25614	25619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009839	T	7	7	25618	25624	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009839	A	6	6	25640	25645	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009839	TGAT	2	8	25647	25654	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009839	CAT	2	6	25670	25675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_009839	T	6	6	26539	26544	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009839	TTTTAT	2	12	26559	26570	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009839	TAA	2	6	26581	26586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009839	T	6	6	26617	26622	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009839	AAGG	2	8	27991	27998	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009839	T	6	6	32562	32567	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009839	T	6	6	32580	32585	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_009839	A	7	7	32634	32640	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009839	TTA	2	6	32647	32652	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009839	TATT	2	8	35861	35868	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009839	TTA	2	6	35871	35876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009839	TA	3	6	35881	35886	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009839	TG	3	6	35947	35952	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009839	T	6	6	36979	36984	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009839	TAA	2	6	37038	37043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009839	TATAT	2	10	37047	37056	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_009839	T	6	6	37063	37068	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_009839	CCA	2	6	37102	37107	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_009839	TA	3	6	37114	37119	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009839	TTTA	2	8	37153	37160	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_009839	T	6	6	37199	37204	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009839	A	7	7	37206	37212	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009839	TAG	2	6	37251	37256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_009839	T	6	6	37303	37308	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009839	T	6	6	37319	37324	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_009839	CTTTT	2	10	37335	37344	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
72	NC_009839	T	6	6	37353	37358	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009839	TTA	2	6	37395	37400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_009839	TAA	2	6	37484	37489	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009839	CTTTT	2	10	37506	37515	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
76	NC_009839	GAA	2	6	37538	37543	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009839	CTAT	2	8	37554	37561	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_009839	T	6	6	37564	37569	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_009839	GGC	2	6	37604	37609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_009839	ACA	2	6	37714	37719	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_009839	TA	3	6	37799	37804	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_009839	GGTAA	2	10	37818	37827	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009839	GAT	2	6	37866	37871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_009839	GCA	2	6	37915	37920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_009839	GCA	2	6	37955	37960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_009839	CGC	2	6	37962	37967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_009839	GGA	2	6	37970	37975	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_009839	GAA	2	6	38011	38016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_009839	CAG	2	6	38059	38064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_009839	TGG	2	6	38218	38223	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_009839	CTG	2	6	38276	38281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_009839	GTT	2	6	38369	38374	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009839	GAA	2	6	38513	38518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_009839	TGC	2	6	38593	38598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_009839	GTC	2	6	38605	38610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_009839	TCGTG	2	10	38614	38623	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
97	NC_009839	AGG	3	9	38713	38721	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_009839	GAC	2	6	38730	38735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_009839	TCA	2	6	38742	38747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_009839	AC	3	6	38768	38773	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_009839	CCT	2	6	39072	39077	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_009839	TAA	2	6	39093	39098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_009839	AT	3	6	39119	39124	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009839	TGA	2	6	39159	39164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_009839	AGG	2	6	39222	39227	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_009839	CCA	2	6	39252	39257	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_009839	TTA	2	6	39259	39264	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_009839	A	6	6	39344	39349	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_009839	A	6	6	39359	39364	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_009839	TA	3	6	39385	39390	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_009839	ATTT	2	8	39428	39435	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_009839	TATTTA	2	12	39493	39504	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_009839	AT	4	8	39521	39528	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_009839	CAAG	2	8	39584	39591	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
115	NC_009839	TAA	2	6	39595	39600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_009839	TCTTT	2	10	39642	39651	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
117	NC_009839	TAA	2	6	39688	39693	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_009839	AAG	2	6	39810	39815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_009839	A	6	6	39864	39869	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_009839	A	6	6	39873	39878	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_009839	CTA	2	6	39885	39890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_009839	TGG	2	6	39899	39904	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_009839	AAG	2	6	39968	39973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_009839	TA	3	6	40030	40035	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_009839	GCG	2	6	40106	40111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_009839	TAGC	2	8	40249	40256	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
127	NC_009839	TGC	2	6	40562	40567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_009839	GGA	2	6	40625	40630	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_009839	TC	3	6	40711	40716	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_009839	AT	3	6	40721	40726	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_009839	CAG	2	6	40835	40840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_009839	GGC	2	6	40844	40849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_009839	CGT	2	6	40863	40868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_009839	AAC	2	6	40878	40883	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_009839	CTTA	2	8	40911	40918	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
136	NC_009839	AGG	2	6	40952	40957	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
137	NC_009839	AGC	2	6	40968	40973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_009839	AAAG	2	8	40982	40989	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_009839	AGTA	2	8	41042	41049	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_009839	CA	3	6	41067	41072	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_009839	ATT	2	6	41079	41084	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_009839	AGT	2	6	41098	41103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_009839	TG	3	6	41110	41115	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_009839	TAAT	2	8	41208	41215	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_009839	AGG	2	6	41413	41418	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
146	NC_009839	GGAT	2	8	41478	41485	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_009839	AGA	2	6	41486	41491	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
148	NC_009839	CCGTA	2	10	41543	41552	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
149	NC_009839	GGTG	2	8	41563	41570	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
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